정화조 청소는 일년에 일회 이상하도록 되어 있습니다. 이를 위반하면 1백만원 이하의 과태료가 부과 되며, 분료를 버리는 행위는 2백만원 이하의 벌금을 물게 됩니다. 또한 정화조나 화장실을 철거 할 때에는 청소 후 철거를 해야 합니다. 그래야 집을 지을 때 착공계를 낼 수 있습니다.
청소 후에는 청소의 근거가 되는 영수증을 꼭 받아야 합니다. 건물의 증축 또는 용도 변경으로 정화조 처리의 용량이 부족하게 되면 시·군·구청장에게 변경신고를 해야 합니다. 다만 방류수 수질기준을 준수할 수 있거나 처리용량의 20/100 미만이신 경우에 정화조 내부청소를 6개월마다 1회 이상 실시할 때에는 증설하지 않으셔도 됩니다.

기초자치 단체 별로 청소대행 회사가 있습니다. 올바른 청소 방법을 소개합니다. 기본이 되는 3 부페식을 위주로 설명 하겠습니다. 우선 2 부페조를 바닥까지 흡입한 뒤 3 여과조 에다 배출을 시킵니다. 이유는 쇄석 사이에 끼여있는 오물을 닦아내기 위함이며 그래야 누적된 찌꺼기를 없애서 더 이상 막히지 않습니다. 그 다음에 다시 2 부페조를 흡입하여야 합니다. 그 다음에 1 부페조를 바닥까지 흡입 후 반 정도를 다시 배출을 한 후 다시 흡입하여야 침전오니를 깨끗이 청소가 됩니다. 바람직한 방법은 삼각발 부분도 뚜껑을 두어서 삼각발 부분에 배출을 하면 더욱 좋습니다. 다른 정화조도 흡입 후 반정도 찰 정도로 배출했다가 흡입하면 깨끗이 청소가 됩니다. 이때 주의해야 할 일은 꼭 반정도 배출을 해야지 그 이상이 되면 오니가 다른 배관으로 흘러가게 되어 위험합니다. 이 같은 청소 방법은 소비자가 요구할 수 있는 권리 입니다. 원칙은 돌을 꺼내어 닦아서 다시 넣어 주도록 되어 있습니다. 삼구각형은 상담실 그림을 참조 하십시오.